Le séquençage et l'assemblage de génomes de référence à partir de données PacBio

Résumé

Depuis bientôt deux ans, les dernières avancées de la technologie de séquençage PacBio ont bouleversé les projets de séquençages génomiques. Non seulement les chromosomes bactériens mais également les chromosomes de nombreux génomes eucaryotes peuvent s’assembler en une seule séquence ou dans le pire des cas en bras chromosomiques. La qualité des assemblages atteint, si ce n’est dépasse, les assemblages de références Sanger des années 2000, les centromères et télomères alors souvent non résolus sont désormais analysables. Les résultats sur plusieurs espèces de bactéries, champignons et plantes seront présentés afin d’illustrer les réussites de cette rupture technologique mais aussi les cas qui restent encore non parfaitement résolus.