Infrastructure PlantBIOs
Accueil
Infrastructure PlantBIOs

Infrastructure - Biocontrôle et Biostimulation des Plantes, Equipements et Expertise

PlantBIOs propose, dans un cadre scientifique d’excellence, équipements et expertise pour des études du gène à l’agroécosystème avec des outils analytiques, des outils expérimentaux et des collections de ressources biologiques rares.

L'infrastructure Scientifique Collective PlantBIOs  

Avec PlantBIOs, dans le domaine du biocontrôle et de la biostimulation des plantes, l’Institut Sophia Agrobiotech a ces dernières années engagé une structuration forte de ses outils et un partenariat actif avec le triple objectif :

 

  • d’accroître l’attractivité scientifique du site via de nouvelles structures matérielles et organisationnelles uniques en France ;
  • de développer des collaborations avec les entreprises afin d’assurer le transfert des résultats de la recherche ;
  • de développer la formation autour du biocontrôle.

PlantBIOs est ouvert à la communauté scientifique académique et privée à qui elle offre :

  • service, mise à disposition d’équipements et expertise ;
  • développements technologiques et méthodologique ;
  • formation.

Pour tout projet de prestation de service ou de collaborations de recherche,
merci de contacter PlantBIOs à l’adresse suivante : isa-plantbios@inrae.fr

PlantBIOs est labelisé ISC (Insfrastructure Scientifique Collective) depuis 2019 par INRAE.

 

Organisation et gouvernance

L'infrastructure PlantBIOs est organisée autour de 3 domaines fonctionnels - Plateaux Analytiques, Collections et Installation Expérimentale - avec 6 composantes au total. PlantBIOs  s’appuie sur une gouvernance collective autour de CSU pour chacune de ses composantes.

PlantBIOs est engagée dans une démarche qualité ISO 9001 qui se déploie à partir du périmètre déjà certifié du CRB Ep’Coll. Nos objectifs dans ce domaine sont déclinés dans notre Politique Qualité.

CSU (Conseil Scientifique d'Utilisation)

 Le CSU a pour mission d’aiguiller les responsables des composantes sur les besoins des utilisateurs en termes d’évolutions techniques, de proposer des pistes pour la recherche de moyens afin d'accompagner ces évolutions et de contribuer aux choix des investissements. En cas de saturation de l’infrastructure, le CSU peut aussi être consulté pour prioriser les projets. Le CSU est composé de représentants des communautés d'utilisateurs et d’experts externes.

L'équipe
 

PlantBIOs constitue aujourd’hui une équipe de ISA qui s’appuie sur un collectif de 21 agents pour 14,2 ETP.

Equipe_inra_image_cut

 

 

Organigramme

 
 

 

Les composantes de l'ISC

 

Des outils analytiques regroupant compétences et équipements dans les domaines de la biochimie analytique, la bioinformatique, l'imagerie cellulaire et le vidéo-phénotypage, (reconnus comme Plateforme par INRAE (CNOC) depuis 2013 - PF SPIBOC).

Biochimie Analytique

Le plateau de biochimie analytique de l’institut Sophia Agrobiotech (ISA) dispose d'un Biacore 3000 et d'un couplage LC-MS/MS. Il s’agit d’un outil collectif commun accessible à tout le personnel d’ISA et également ouvert à l’extérieur (académique et secteur privé - cf modalités d’accès). Ce plateau, mis en place en 2010, par l’ancienne UMR IBSV (Interactions Biotiques et Santé Végétale) est géré par Aurélie Séassau aidée par un référent scientifique.

Aurélie SEASSAU (Resp. op.)
Georges DE SOUSA (Resp.Sc.)

BioInformatique et Génomique

Le plateau de bioinformatique a pour objectif de mutualiser les moyens et les compétences en bioinformatique de l'ISA afin de prendre en charge et d'optimiser le traitement des données des projets « omiques » de plus en plus nombreux. L'activité du plateau est centrée sur l'analyse de séquences dans le domaine des interactions entre plantes et bio-agresseurs ou symbiontes. Il mutualise ses efforts autour du développement de programmes et d'outils originaux pour répondre au mieux aux besoins des biologistes et aux questions scientifiques posées.

Corinne RANCUREL (Resp. op.)
Etienne DANCHIN (Resp.Sc.)
Martine DA ROCHA
Arthur PERE

Imagerie Cellulaire

Le plateau d'imagerie cellulaire fait partie de l'Institut Sophia Agrobiotech (ISA) (Pôle Santé des Plantes-INRA PACA). Il est une composante de la plateforme Microscopie et Imagerie de la Côte d’Azur (MICA), labellisée par IBiSA et de la plateforme Santé des Plantes Interactions Biotiques Outils scientifiques Collectifs (SPIBOC), labellisée par la CNOC. Accessible à tout le personnel d'ISA, il a également vocation à accueillir des extérieurs (secteur public ou privé).

Olivier PIERRE (Resp. op.)
Janice DE ALMEIDA ENGLER (Resp.Sc.)

Vidéo-Phénotypage

Le plateau de vidéo-phénotypage (PVP) vise à proposer des équipements et expertises en acquisition et analyses d’images/vidéos, à destination des équipes de l’unité mixte de recherche Institut Sophia Agrobiotech et de partenaires extérieurs, académiques ou privés. Ce plateau dispose de 4 des 15 pièces climatiques de la nouvelle installation PheHome. Les équipements de PheHome, dont ceux du plateau PVP (avec notamment trois stations d’acquisition vidéo haut débit), ont été financés par le CPER SABLES.

Silène LARTIGUE (Resp. op.)
Vincent CALCAGNO (Resp.Sc.)

 

Collection de Ressources Biologiques

PlantBIOs compte également une  Collection de Ressources Biologiques rares de trichogrammes (parasitoïdes oophages), le CRB Ep-Coll, collection labellisée IBiSA, certifiée ISO 9001, et rattachée au pilier Environnement de l'Infrastructure de Recherche nationale RARe.

Nicolas RIS (Resp.Sc.)
Sylvie WAROT

 

Installation Expérimentale

Enfin, PlantBIOs comprend une Installation Expérimentale (IE) identifiée par INRAE (CNUE) en 2014. Cette IE permet la production de matériel biologique (plantes et insectes) et l'expérimentation en conditions contrôlées avec : 80 pièces climatiques et 2500 m2 de serres.

Michela ION-SCOTTA (Resp. op.)
Valérie ALLASIA (Ref. Tech. Trangénèse)
Nicolas BOROWIEC (Ref. Tech. Entomopolis)
Laurent KREMMER (Ref. Tech. PheHome)
Marc BOSSENO (Ref. Tech. P. Clim)
Lionel SALVY ( Ref. Tech. Serres)
Isabelle Bruneau De Miré
José BAZZANO
Inessa BUCH
Sylvain NUEE
Gabriel ZIZZO

 

Télécharger la plaquette PlantBIOs (en anglais) ci-dessous :

 

Date de modification : 21 mai 2024 | Date de création : 12 décembre 2017 | Rédaction : khugot