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Infrastructure - Biocontrôle et Biostimulation des Plantes, Equipements et Expertise

PlantBIOs propose, dans un cadre scientifique d’excellence, équipements et expertise pour des études du gène à l’agroécosystème avec des outils analytiques, des outils expérimentaux et des collections de ressources biologiques rares.

 

Avec PlantBIOs, dans le domaine du biocontrôle et de la biostimulation des plantes, l’Institut Sophia Agrobiotech a ces dernières années engagé une structuration forte de ses outils et un partenariat actif avec le triple objectif :

  • d’accroître l’attractivité scientifique du site via de nouvelles structures matérielles et organisationnelles uniques en France ;
  • de développer des collaborations avec les entreprises afin d’assurer le transfert des résultats de la recherche ;
  • de développer la formation autour du biocontrôle.

PlantBIOs est ouvert à la communauté scientifique académique et privée à qui elle offre :

  • service, mise à disposition d’équipements et expertise ;
  • développements technologiques et méthodologique ;
  • formation.

Pour tout projet de prestation de service ou de collaborations de recherche,
merci de contacter PlantBIOs à l’adresse suivante : isa-plantbios@inrae.fr

PlantBIOs est labelisé ISC (Insfrastructure Scientifique Collective) depuis 2019 par INRAE et certifié ISO 9001 depuis Mai 2024.

 

Organisation et gouvernance

L'infrastructure PlantBIOs est organisée autour de 3 domaines fonctionnels - Plateaux Analytiques, Collections et Installation Expérimentale - avec 6 composantes au total. PlantBIOs  s’appuie sur une gouvernance collective autour de CSU pour chacune de ses composantes.

CSU (Conseil Scientifique d'Utilisation)

 Le CSU a pour mission d’aiguiller les responsables des composantes sur les besoins des utilisateurs en termes d’évolutions techniques, de proposer des pistes pour la recherche de moyens afin d'accompagner ces évolutions et de contribuer aux choix des investissements. En cas de saturation de l’infrastructure, le CSU peut aussi être consulté pour prioriser les projets. Le CSU est composé de représentants des communautés d'utilisateurs et d’experts externes.

L'équipe

 

PlantBIOs constitue une équipe de ISA qui s’appuie sur un collectif de 23 agents pour 14 ETP.

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Organigramme PlantBIOs

 

Les composantes de l'ISC

 

Plateau de spectrométrie de masse pour biomolécules en santé des plantes (SMBIOSP)

SMBIOSP réalise des analyses de protéomique et métabolomique par spectrométrie de masse. En amont le plateau accompagne dans la préparation de leurs échantillons les chercheurs et étudiants et en aval les assiste dans le traitement et l’interprétation des données.

Plateau de BioInformatique et Génomique (BIG)

Le plateau de bioinformatique a pour objectif de mutualiser les moyens et les compétences en bioinformatique de l'ISA afin de prendre en charge et d'optimiser le traitement des données des projets omiques de plus en plus nombreux. L'activité du plateau est centrée sur l'analyse de séquences dans le domaine des interactions entre plantes et bio-agresseurs ou symbiontes. Il mutualise ses efforts autour du développement de programmes et d'outils originaux pour répondre au mieux aux besoins des biologistes et aux questions scientifiques posées.

Plateau d'Imagerie Cellulaire (MIC)

Le plateau MIC assiste et forme scientifiques et étudiants à l’utilisation d’un large panel technologiques et méthodologiques en microscopie photonique et analyse d’image. Intégré à la dynamique de recherche d’ISA, MIC coordonne les besoins en imagerie et offre son expertise aux différentes équipes sur une grande diversité de modèles biologiques. Enfin le plateau assure, en collaboration, un développement méthodologique diversifié.

Mic est une composante de la plateforme Microscopie et Imagerie de la Côte d’Azur (MICA), labellisée par IBiSA.

Plateau de Vidéo-Phénotypage (PVP)

Le phénotypage est la caractérisation de traits d’un individu, comme la morphologie, la longévité ou le comportement (activité, mouvement, prédation, etc.). PVP met à disposition des équipements et des expertises pour l’acquisition et l’analyse d’images et de vidéos permettant de phénotyper des arthropodes d’intérêt pour le biocontrôle.

Ce plateau aide à la conception de protocoles, met à disposition et forme à l’utilisation d’équipements, forme et participe à l’analyse d’images et de vidéos. Il développe des outils de phénotypage basés sur des techniques d’analyses d’images et de vidéos. Cette offre est à destination des partenaires académiques ou privés travaillant sur le phénotypage d’arthropodes ou d’autres organismes d’intérêt pour le biocontrôle et l’agroécologie.

 

Collection de Ressources Biologiques (CRB Ep-coll)

PlantBIOs compte également une  Collection de Ressources Biologiques rares de trichogrammes (parasitoïdes oophages), le CRB Ep-Coll, collection labellisée IBiSA, certifiée ISO 9001, et rattachée au pilier Environnement de l'Infrastructure de Recherche nationale RARe.

 

Installation Expérimentale (IE)

L’IE, composée d’un parc important de serres et de pièces climatiques pour l’élevage d’insectes et la culture de plantes, centralise une expertise portée par les équipes de recherche dans ces domaines avec l’ambition de la mutualiser et la partager.

L’IE déploie et met à disposition un ensemble d’équipements permettant d'étudier de multiples modèles biologiques en conditions contrôlées ou semi-contrôlées et forme les chercheur.e.s et étudiants.e.s à leur utilisation. Dans le cadre de collaborations de recherche, l’installation expérimentale développe de nouvelles approches méthodologiques pour répondre aux besoins expérimentaux actuels et futures des utilisateurs publics et privés.

 

 

Date de modification : 12 août 2024 | Date de création : 12 décembre 2017 | Rédaction : khugot