Le séquençage longues lectures (Oxford Nanopore) et ses applications au Genoscope

Résumé

Le séquençage par nanopore est une technologie prometteuse qui permet de déterminer la séquence d'un fragment d'ADN sans amplification et par lecture directe. Commercialisée depuis peu mais disponible depuis 2014 sous la forme d'un appareil miniature (MinION). Le MinION permet à présent de séquencer des génomes complexes à faible coût. A ce jour, le séquenceur disponible peut générer plusieurs gigabases de données et peut séquencer des fragments de l'ordre du mégabase. Nous verrons comment la technologie a évolué au cours des deux dernières années et quelles sont aujourd'hui les applications possibles. Pour finir, nous verrons les évolutions à venir et notamment les premiers résultats de la version haut débit du séquenceur (PromethION) qui promet de faire passer le cout du séquençage d'un génome humain sous les 1000$.