Résumé

Les multi-infections bactériennes sont très fréquentes dans le règne animal. Elles jouent probablement un rôle physiologique et écologique important car le phénotype de l’hôte résulte de la contribution d’une multitude de génomes, mais les conséquences sont souvent méconnues. Chez les arthropodes et notamment chez les insectes, de nombreuses bactéries sont transmises maternellement d’une génération à l’autre, c’est donc une véritable communauté symbiotique qui est transmise à la descendance. La stabilité de ces associations permet d’étudier les relations des hôtes et des bactéries mais également d’intégrer la dynamique de chaque génotype bactérien et leurs interactions qui vont se répercuter directement sur la relation avec l’hôte et donc sur l’évolution de l’association. Par des approches d’écologie, de génétique et de génomique évolutives nous étudions ces interactions à différents niveaux d’organisation, depuis le gène jusqu’à la communauté. Cela nous permet d’aborder différentes questions, notamment : quelle est la dynamique d’acquisition / perte des symbioses à l’échelle des communautés ; quels sont les mécanismes de transferts horizontaux ? ; dans quelle mesure, et par quels mécanismes moléculaires et évolutifs, les symbiotes contribuent-ils au phénotype et à sa variabilité naturelle ?