MALAUSA Thibaut
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MALAUSA Thibaut

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31 décembre 2011

Chargé de Recherche

Évolution des population d'auxiliaires des cultures utilisés en lutte biologique; utilisation de méthode d'écologie moléculaire dans les programmes de lutte biologique.

Thématique

Mon projet de recherche vise à concilier recherche en biologie évolutive et appui au développement de programmes et solutions de lutte biologique contre les ravageurs des cultures.

Ma question de recherche : quelle est l'influence des caractéristiques génétiques des populations introduites sur leur succès d'établissement dans un nouvel environnement et sur l'évolution à court terme de leurs traits phénotypiques.

Cette question est posée via des expérimentations utilisant comme matériel biologique des auxiliaires des cultures en cours d'évaluation ou d'introduction dans des programmes de lutte biologique.

L'intégration de questions de recherche au sein des programmes de lutte biologique nécessite de trouver des programmes compatibles avec les questions posées et d'y intégrer des méthodes et outils d'analyse génétique. Une partie substantielle de mon activité consiste donc à créer des opportunités de collaboration avec des équipes de lutte biologique et à faciliter le développement de leurs projets à l'aide de différentes méthodes (méthodes d'identification moléculaire notamment).

Exemples de programmes de lutte biologique intégrant des expérimentations de biologie évolutive

1. Importation et utilisation de l'hyménoptère parasitoïde Allotropa burrelli (Hymenoptera: Platygastridae) contre la cochenille farineuse Pseudococcus comstocki en vergers de pommiers

Questions de recherche intégrées : 

- Quel est l'impact de la consanguinité sur les traits phénotypiques et la capacité d'établissement des populations d'A. burrelli.

- Quelles sont les importances relatives des facteurs génétiques (diversité génétique initiale des populations) et démographiques (densité initiale des populations) lors des premières générations suivant l'arrivée des populations dans un nouveau milieu.

Financement : Projet INRA Département Santé des Plantes et Environnement; Agence Nationale de la Recherche JCJC "BICORAMICS"

2. Importation et utilisation de l'hyménoptère parasitoïde Mastrus ridens (Hymenoptera: Ichneumonidae) contre le carpocapse du pommier.

Questions de recherches intégrées :

- Quelle est l'influence de la composition génétique initiale des populations dans les deux situations (i) "Single Large Population" et (ii) "Several Small Populations" (SLOSS hypothesis).

Financement : Projet CONICYT (Chili), Projet FP7-People-IRSES "BIOMODICS" (2014-2017)

3. Développement de méthodes de production de masse pour trois auxiliaires produits dans un contexte commercial

Question de recherche : à quelle fréquence observe-t-on des impacts négatifs de la consanguinité dans des populations en cours d'établissement dans un nouveau milieu (ici, les conditions de laboratoire ou de production industriel) ?

Financement : Projet FP7-People-IAPP "COLBICS" (2013-2016)

Exemples de méthodes développées pour l'appui des programmes de lutte biologique

1. Méthode économique de développement de marqueurs génétiques microsatellites

En collaboration avec l'entreprise Genoscreen (Lille, France), l'Université de Provence et Montpellier SupAgro : production de banques de microsatellites par pyroséquençage GS-FLX 454 d'ADN enrichi en microsatellites.

Financement : INRA AIP Bioressources "EcoMicro" (2009)

2. Développement, test et utilisation de marqueurs génétiques pour l'identification taxonomique des cochenilles farineuses et les hyménoptères auxiliaires des cultures.

Financement: ANR JCJC "Bicoramics", FP7-People-IRSES "IPRABIO" (2011-2014).

3. Développement d'un logiciel permettant de concevoir des réactions de PCR espèce-spécifique pour l'identification rapide d'espèces de ravageurs ou auxiliaires (SP-Designer).

Financement: ANR JCJC "Bicoramics", FP7-People-IRSES "IPRABIO" (2011-2014).

Contrat de Recherches

  • 2013-2016: FP7-IAPP: “COLBICS”: Intersectoral collaborations to boost the dynamics of Research and development in biological control of agricultural pests (coordinator)(2,700 K€).
  • 2011-2014: ANR JCJC “Bicoramics”: Using a biological control operation to approach demogenetic dynamics of invasive populations » (coordinator)(200 K€).
  • 2011-2014: FP7-IRSES: “IPRABIO”: Integrating new practices in biological control programs against agricultural pests (coordinator) (190 K€).
  • 2011-2012: CNRS-Tubitak (Turquie): Using a biological control operation to approach demogenetic dynamics of invasive populations » (coordinator)(10K€).
  • 2011-2014: FP7-Collab: “PURE” Integrated pest management in farming systems of major importance for Europe (participant)(30K€).
  • 2011-2014: RTRA: “BIOFIS” Bioagresseurs et espèces invasives : de l’individu aux populations et aux espèces (workpackage coordinator)(30K€).
  • 2010: CNPq (Brazil). Cochonilhas farinhentas (Hemiptera: Pseudococcidae) associadas à uvas (Vitis vinifera) em diferentes regiões produtoras do Brasil (participant)(30K€).
  • 2009-2010: INRA AIP Bioressources « EcoMicro » : Mise au point collective d’une méthode de production de banques d’ADN microsatellite sur plateforme de pyroséquençage (contrat de recherche public/privé INRAGenoscreen- Université de Provence-Montpellier SupAgro) (coordinator)(100K€).
  • 2009-2010: PHC Imhotep « Molecular tools in the service of biological control of mealybugs by parasitoids in some major crop systems » (coordinator)(6 K€).
  • 2009-2010: France Agrimer. Lutte biologique contre les cochenilles en cultures pérennes (participant)(100K€).
  • 2009-2010: AAP INRA SPE : « Une opération de lutte biologique comme modèle d’étude de biologie de l’invasion ». (coordinator)(30K€).
  • 2009: Conseil Général des Alpes Maritimes. Mise au point d’outils d’identification des cochenilles farineuses (coordinator)(6K€).
  • 2007-2009: AAP INRA SPE « Dynamiques locales de populations françaises de la coccinelle invasive Harmonia axyridis » (coordinator)(30K€).

Publications

  • Villard P, Malausa T. 2013. SP-Designer: a user-friendly program for designing species-specific primer pairs from DNA sequence alignments. Molecular Ecology Resources, in press.
  • Bernardi D, Botton M, da Cunha US, Bernardi O, Malausa T, Garcia MS, Nava DE. 2013. Effects of azadirachtin on Tetranychus urticae (Acari: Tetranychidae) and its compatibility with predatory mites (Acari: Phytoseiidae) on strawberry. Pest Management Science 69: 75-80.
  • Fauvergue X, Vercken E, Malausa T, Hufbauer R. 2012. The biology of small, introduced populations, with special reference to biological control. Evolutionnary Applications 5: 424-443.
  • Abd-Rabou S, Shalaby H, Germain JF, Ris N, Kreiter P & Malausa T. Identification of mealybug pest species (Hemiptera: Pseudococcidae) in Egypt and France: a DNA barcoding approach. Bulletin of Entomological Research 102: 515-523.
  • Correa M, Germain JF, Malausa T, Zaviezo T. Molecular and morphological characterization of mealybugs (Hemiptera: Pseudococcidae) from vineyards of central Chile. Bulletin of Entomological Research 102: 524-530.
  • Beltrà A, Soto A, Malausa T. 2011. Molecular and morphological characterisation of Pseudococcidae surveyed on crops and ornamental plants in Spain. Bulletin of Entomological Research 102: 165-172.
  • Cheyppe-Buchmann S, Bon MC, Warot S, Jones W, Malausa,T, Fauvergue X, Ris N. 2011. Molecular characterization of Psyttalia lounsburyi, a candidate biocontrol agent of the olive fruit fly, and its Wolbachia symbionts as a pre-requisite for future intraspecific hybridization. Biocontrol 56: 713-724.
  • Midamegbe A, Vitalis R, Malausa T, Delava E, Cros-Arteil S and Streiff R. 2011. Scanning the European corn borer (Ostrinia spp.) genome for adaptive divergence between host-affiliated sibling species. Molecular Ecology 20: 1414–1430.
  • Correa M, Aguirre C, Germain JF, Hinrichsen P, Zaviezo T, Malausa T & Prado E. 2011. A new species of Pseudococcus (Hemiptera: Pseudococcidae) from Chile: morphological and molecular description. Zootaxa 2926: 46-54.
  • Gilles A, Meglecz E, Pech N, Ferreira S, Malausa T, Martin JF. 2011. Accuracy and quality assessment of 454 GS-FLX pyrosequencing. BMC Genomics 12: 245.
  • Guichoux E, Lagache L, Wagner S, Chaumeil P, Léger P, Lepais O, Lepoittevin C, Malausa T, Revardel E, Salin F, Petit R. 2011. Current trends in microsatellite genotyping. Molecular Ecology Resources 11 : 591-611.
  • Malausa T, Gilles A, Meglécz E, Ferreira S, Pech N et al. 2011. High-throughput microsatellite isolation through 454 GS-FLX Titanium pyrosequencing of enriched DNA libraries. Molecular Ecology Resources 11:638-644.
  • Sinama M, Dubut V, Costedoat C, Gilles A, Junker M, Malausa T, Martin JF, Neve G, Pech N, Schmitt T, Zimmermann M, Meglecz E. 2011. Challenges of microsatellite development in Lepidoptera: Euphydryas aurinia (Nymphalidae) as a case study. European Journal of Entomology 108: 261-266.
  • Malausa, T., Fenis A, Warot S, Germain JF, Ris N, Prado E, Botton M, Vanlerberghe-Masutti F, Sforza R, Cruaud C, Couloux A & Kreiter P. 2011. DNA markers to disentangle complexes of cryptic taxa in mealybugs (Hemiptera: Pseudococcidae). Journal of Applied Entomology 135: 142-155.
  • Martin JF, Pech N, Meglécz E, Ferreira S, Costedoat C, Dubut V, Malausa T and GillesA. 2010. Representativeness of microsatellites distribution in genomes as revealed by 454 GS-FLX Titanium pyrosequencing. BMC Genomics 11: 560.
  • Castagnone-Sereno P, Danchin EGJ, Deleury E, Guillemaud T, Malausa T and Abad P. 2010. Genome-wide survey and analysis of microsatellites in nematodes, with a focus on the plant-parasitic species Meloidogyne incognita. BMC Genomics 11:598.
  • Andris M, Aradottir GI, Arnau G et al (Mol Ecology Resources Primer Dev C), 2010. Permanent Genetic Resources added to Molecular Ecology Resources Database 1 June 2010-31 July 2010. Molecular Ecology Resources 10:1106-1108.
  • Meglecz, E, Costedoat C, Dubut V, Gilles A, Malausa T et al., 2010 QDD: a user-friendly program to select microsatellite markers and design primers from large sequencing projects. Bioinformatics 26: 403-404.
  • Dubut V, Grenier R, Meglécz E, Chappaz R, Costedoat C, Danancher D, Descloux S, Malausa T, Martin JF et al., 2010. Development of 55 novel polymorphic microsatellite loci for the critically endangered Zingel asper L. (Actinopterygii: Perciformes: Percidae) and cross-species amplification in five other percids. European Journal of Widlife Research 56:931-938.
  • Lombaert E, Guillemaud T, Cornuet JM, Malausa T, Facon B et al. 2010. Bridgehead Effect in the Worldwide Invasion of the Biocontrol Harlequin Ladybird. Plos One 5.
  • Loiseau A, Malausa T, Lombaert E, Martin JF and Estoup A. 2009. Isolation and characterization of microsatellites in the harlequin ladybird, Harmonia axyridis (Coleoptera, Coccinellidae), and cross-species amplification within the family Coccinellidae. Molecular Ecology Resources 9: 934-937.
  • Lombaert E, Malausa T, Devred R and Estoup A. 2008. Phenotypic variation in invasive and biocontrol populations of the harlequin ladybird, Harmonia axyridis. Biocontrol 53: 89-102.
  • Malausa T, Pelissie B, Piveteau V, Pelissier C, Bourguet D et al. 2008. Differences in oviposition behaviour of two sympatric sibling species of the genus Ostrinia. Bulletin of Entomological Research 98: 193-201.
  • Malausa T, Dalecky A, Ponsard S, Audiot P, Streiff R et al. 2007. Genetic structure and gene flow in French populations of two Ostrinia taxa: host races or sibling species? Molecular Ecology 16: 4210-4222.
  • Malausa, T., L. Leniaud, J. F. Martin, P. Audiot, D. Bourguet et al. 2007. Molecular differentiation at nuclear loci in French host races of the European corn borer (Ostrinia nubilalis). Genetics 176: 2343-2355.
  • Leniaud L, Audiot P, Bourguet D, Frerot B, Genestier G, Lee SF, Malausa T et al. 2006. Genetic structure of European and Mediterranean maize borer populations on several wild and cultivated host plants. Entomologia Experimentalis et Applicata 120: 51-U54.
  • Malausa T, Salles M, Marquet V, Guillemaud T, Alla S et al. 2006 Within-species variability of the response to 20-hydroxyeedysone in peach-potato aphid (Myzus persicae Sulzer). Journal of Insect Physiology 52: 480-486.
  • Malausa T, Bethenod MT, Bontemps A, Bourguet D, Cornuet JM et al., 2005 Assortative mating in sympatric host races of the European corn borer. Science 308: 258-260.
  • Malausa T, Guillemaud T and Lapchin L. 2005. Combining genetic variation and phenotypic plasticity in tradeoff modelling. Oikos 110: 330-338.

Contact: Thibaut.Malausa@inrae.fr

Date de création : 13 septembre 2023